Вейерхаузер начал свою карьеру в Германии, работая на ферме и винограднике. В 1852 году он эмигрировал в США, где сначала работал на пивоварне, а затем на лесопилке. В 1856 году он переехал в Рок-Айленд, штат Иллинойс, где начал работать на строительстве железной дороги.