Проблема тут в том, что GitHub — это инструмент для разработки. Он неудобен для менеджмента и отслеживания истории изменений. Иными словами, нет понимания, на какой стадии находится проект в конкретный промежуток времени. Это мешает, например, проджекту отчитаться о прогрессе владельцу проекта. К тому же, задачи по проекту ставятся в Бирикс24, а без связки GitHub с CRM разработчик запутается, какие коммиты к чему относятся. Поиск коммита, который привел к багам, непосредственно в GitHub займет больше времени, чем если бы искать его в конкретной задаче, над которой он вел работу.